“Deltacron”混合COVID变体已被确定。你应该担心吗?

美国已经发现了一些由欧米克隆-德尔塔杂交病毒引起的新冠肺炎病例,其中包括卫生官员本周在加州报告的至少一例病例,但科学家们说,所谓的德尔塔克隆病毒变体看起来不太可能取代它的父母之一,引发另一场冠状病毒的爆发。

这种俗称为deltacron的病毒——世界卫生组织认为它的威胁还不够严重,还没有从希腊字母中取一个字母来命名它——似乎是从一种叫做重组的过程中发展而来的,在这种过程中,一个人同时感染了两种变体,就会产生一种新的变体。圣马特奥(San Mateo)基因组测序公司Helix的一组科学家证实了两例delta-omicron重组,这项未经同行评议的研究将在未来几天发表。

重组可能会引起人们的关注,因为它允许病毒突然发生许多突变,而不是随着时间的推移缓慢进化。从理论上讲,重组可能导致具有亲本菌株最令人不安的特征的变体-例如,令人难以置信的传染性与三角洲病毒的严重性混合在一起。

但这似乎并没有发生在德尔塔龙身上。专家说,科学家们还没有对这种新变异进行足够的研究,无法完全描述它的特征,但已经发现的病例很少,这表明它无法与组粒或德尔塔基因竞争。他们说,迄今为止发现的少数病例更多的是生物学上的好奇,而不是引起关注。

“最糟糕的是,如果你感染了一种与(omicron)一样具有传染性的病毒,但却携带了三角洲病毒的毒性。旧金山格莱斯顿研究所(Gladstone Institutes)的高级研究员华纳·格林(Warner Greene)博士说,“这种病毒似乎没有获得高传染性,否则它现在很可能已经接管了。”

Deltacron于今年早些时候在欧洲首次被报道,但这些最初的病例后来被认为可能是由于实验室污染而被驳回,这是不寻常的,但对于基因组测序来说并不罕见。然而,最近全球报道了更多的病例,其中包括一些科学家已经能够证明是由重组引起的病例。

周二,世卫组织一名高级流行病学家在推特上表示,病毒重组“是可以预料的,特别是在欧米克隆和德尔塔病毒密集循环的情况下”。在加州,州流行病学家埃里卡·潘博士(Dr. Erica Pan)本周表示,至少发现了一例德尔塔龙病例,但她没有看到特别令人担忧的证据。

登录必赢亚洲旧金山湾区的科学家们一致认为,由于三角洲和组粒共同感染而导致的重组并不奇怪。从去年11月到今年2月,这两种变异在世界上的大部分地区都是重叠的,直到欧米克隆接管,而德尔塔病毒几乎消失。因此,科学家们预计,一些人可能同时感染了这两种变体,在少数情况下,这些变体可能在体内复制时交换了突变。

然而,寻找重组的证据可能很棘手,因为它需要对大量的测序数据进行分类,并解开多个病毒株的纠缠。

随着时间的推移,病毒在繁殖时往往会发生突变,从而改变特征。长期以来,卫生专家一直对SARS-CoV-2(导致COVID的病毒)的猖獗传播感到震惊,因为更多的繁殖意味着更多的机会发生突变,并可能获得使其更具传染性或更能逃避免疫或导致严重疾病的特征。事实上,在整个冠状病毒大流行期间,SARS-CoV-2的演变和新变种的产生不断颠覆控制疾病传播的努力,导致每隔几个月就会出现新的激增。

重组作为形成新变体的潜在途径也被广泛讨论:本质上,一个变体的大量基因组序列被另一个变体的物质所取代。

科学家们注意到,迄今为止,从α到欧米克龙,在世界范围内占主导地位的基因变体,似乎都不是通过重组而产生的。就连染色体组粒(omicron)也被认为是经过一段时间的进化而非自发形成的,科学家们在去年11月发现它有许多突变,这让科学家们感到震惊。

Helix的首席科学官、重组论文的作者之一威廉·李(William Lee)说:“欧米克隆不是由重组产生的,但从理论上讲,重组可能会带来进化优势的大幅提升。”

Helix已经为美国疾病控制和预防中心做了一年多的基因组测序工作,并且可以获得来自全国各地的样本。今年早些时候,那里的科学家决定开始寻找共同感染和可能重组的例子。

他们分析了近3万个样本,并确定了20个共感染。从这20个样本中,他们发现了两个重组案例。科学家们说,发现如此少的重组事件应该让人放心。

斯坦福临床病毒学实验室(Stanford Clinical Virology Laboratory)的负责人本杰明·平斯基(Benjamin Pinsky)博士没有参与Helix的研究,他说:“这更多的是将重组作为一种创造病毒多样性的额外方法,而不是那种我们需要对这种特殊的重组感到超级害怕的想法。”“最坏的情况是,如果重组,我们会得到两个世界最坏的结果。从目前的证据来看,这种变异似乎并非如此。”

科学家们说,他们可能永远无法完全理解重组是如何在deltacron中发挥作用的——它是导致更严重的疾病,还是逃避免疫,还是有其他特征使其比其他变体更具威胁性。尽管“最坏情况”的δ和组粒组合的可能性似乎令人担忧,但平斯基指出,从某种意义上说,每种变体的各种突变可能会相互抵消。

例如,他说:“一些使组粒更具传染性的突变也可能使其不那么严重。”“我们不一定了解病毒的这些特征是如何交织在一起的。”

Erin Allday是《旧金山纪事报》的特约撰稿人。电子邮件:eallday@sfchronicle.comTwitter:@erinallday

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