欧米克隆XE到达加州了吗?以下是我们对新COVID亚变体的了解

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什么是omicron XE?

XE型被专家称为BA.1和BA.2型的“重组型”。加州大学伯克利分校创新基因组学研究所的高级基因组学科学家Stacia Wyman说，它的名字来源于为重组体分配的“X”前缀。

加州科学院科学主任香农·贝内特(Shannon Bennett)表示，冠状病毒“很容易”进行重组。然而，能否检测到重组取决于两个亲本菌株是否有足够的不同，她说。

怀曼说，XE亚型可能是由一个同时感染了BA.1和BA.2版本病毒的人引起的。她解释说:“当病毒复制时，出现了一个错误，导致两种病毒结合在一起。”“然后合并的病毒复制并传播给其他人。”

XE的基因组序列的第一部分是BA.1，“然后其余部分的基因组序列变成BA.2，”她说。S基因，或刺突蛋白——附着在健康细胞上并引起感染——来自BA.2。然而，怀曼说，目前还不清楚以前感染过BA.2病毒的人是否会对XE产生一些保护作用。

XE与之前的版本相比如何?

班尼特说，由于XE是BA.1和BA.2的结合体，它“与两者既有相似之处，也有不同之处”，但从公共卫生的角度来看，这种变体的“传染性、逃避预先免疫的能力和传播性”仍在研究中。

根据…3月25日报道根据英国卫生安全局的数据，“XE的增长率比BA.2高9.8%，”怀曼表示，这意味着它的传染性要高出9.8%。世界卫生组织此前曾报道过这一情况这个数字可能是10%尽管现在下结论还为时过早。

在哪里发现的?

XE亚型最早是在英国发现的1月中旬．截至4月5日，1125例进行了测序在那里。

据怀曼公司称，到目前为止，在美国，威斯康辛州有两例XE病例，纽约州有一例。她周二表示，她已经了解到加州有两例未经确诊的病例。他们还没有在国际测序数据库GISAID上被归类为XE，但已经在加州大学圣克鲁斯分校的基因组分析工具UShER和瑞士巴塞尔大学的NextClade上被分类。

该亚变异也在泰国，印度和以色列新闻报道称。周一,日本宣布一名来自美国的旅客感染了XE病毒株，但没有症状。

XE会成为主导变种吗?

根据世卫组织的数据，在截至4月9日的一周内，BA.2亚型占美国新冠肺炎病例的86%疾病控制和预防中心．它已经迅速超过了最初的组粒变异BA.1, BA.1在截至3月12日的一周内占据主导地位，有59%的测序病例，并导致了迄今为止大流行的最大激增。

BA.2亚型导致美国的病例激增，主要是在东海岸，这促使费城官员本周采取措施恢复本市室内戴口罩的规定．美国官员周三延长了协议期限全国航空旅行要求戴口罩和公共交通，定于周一到期，再延长15天，以便有更多时间学习和监测BA.2。

专家表示，任何比其他病毒更具传染性的新变种都有可能最终占据主导地位。贝内特表示，XE“肯定能”超越BA.2，因为“每一种取代它的变体都可能是更好的传播者。”

但怀曼说，她还不太担心XE。

她说:“有一些早期证据表明，它可能比BA.2更具传染性，但目前数量太少，无法得出任何明确的结论。”“这是需要密切关注的事情，但不需要让普通大众担心。”

她补充说，XE“可能完全在区域内消失，从未传播过”，这种情况在不同地区也发生过，但没有明确的解释。

现在还有什么其他的变体可以看吗?

怀曼指出，另一个版本BA.2.12.1在美国受到“密切监控”根据CoV-Spectrum的数据到目前为止，美国已经有1119个序列，其中19个在加州。

怀曼说，BA.2.12.1在美国一半以上的州都被发现。

她说:“我们看到它在美国迅速蔓延，尤其是在纽约。”“这与BA.2的显著区别在于增加了S:L452Q突变，该突变与免疫逃避有关。”

纽约州卫生部周三表示发布公告关于BA.2.12.1和另一种菌株BA.2.12——这两种菌株都是BA.2的亚系——称它们是该州中部感染率上升的原因之一。

官员们说:“该部门的发现是美国首次报道的由新亚型引起的重大社区传播实例。”

官员们说，这两种亚型的传染性估计比BA.2高23%-27%。官员们说，虽然“目前还没有证据表明这些亚变体会增加疾病的严重程度”，但他们正在密切关注任何变化。

他们敦促纽约人全面接种疫苗并加强免疫接种;在公共室内场所戴口罩;在接触、出现症状或旅行后接受检测;在检测呈阳性后呆在家里，并咨询他们的健康提供者;并在复活节和逾越节期间改善室内通风或聚集在室外，以减少传播风险。

Kellie Hwang是《旧金山纪事报》的特约撰稿人。电子邮件:kellie.hwang@sfchronicle.comTwitter:@KellieHwang