亨利·哈德利(1911-1915)乐团的首任音乐总监是一位美国人——在当时和现在的杰出指挥家中，这是罕见的——他以多产的作曲家而闻名。乐团演奏了他的五部交响曲中的一些，后来他在大都会歌剧院指挥了他的歌剧《克利奥帕特拉之夜》。
阿尔弗雷德·赫兹(1915-1930)随着德国出生的赫兹的到来，旧金山恢复了传统的风格。在他的任期内，交响乐团成为了一个全职的专业乐团，录制了唱片，并推出了一系列的现场广播。
巴兹尔·卡梅伦(1930-1932)和伊赛·多布朗(1930-1935)一个是温文尔雅的英国人，另一个是脾气火爆的俄罗斯人，这对指挥家的组合令人难以置信，在多布朗赢得短暂的续约合同之前，他们共同领奖台了几年。这对乐团的艺术和财务状况都没有太大影响。
皮埃尔·蒙托(1935-1952)这位法国指挥家最为人所知的可能是1913年领导了斯特拉文斯基(Stravinsky)的《春之祭》(The Rite of Spring)在巴黎的首演，他为交响乐团开创了一个黄金时代。蒙托第一次将乐团转变为一流的乐团，扩大了其曲目，并制作了大量令人印象深刻的唱片。人们经常看到他在城市的街道上遛着他的迷你贵宾犬菲菲，菲菲是他们一起旅行的回忆录《每个人都是某个人》(Everyone is Someone)的作者。
恩里克·乔丹(1954-1963)这位西班牙指挥家的任期陷入了争议之中，音乐家、评论家和观众都在争论他的优点、优点和缺点，有时甚至用夸张的措辞。乔丹
约瑟夫·克里普斯(1963-1970)克里普斯出生在维也纳，作为纳粹的难民来到美国，他把旧世界的感性带到了自己的工作中，强调标准曲目和高技术标准。
小泽征尔(1970-1977)这位魅力非凡的年轻日本指挥家以长发、高领毛衣和珠饰而闻名，在70年代成为交响乐团的形象领袖。但他的领导能力参差不齐，他的大部分任期都是在旧金山交响乐团和波士顿交响乐团之间度过的，他后来在波士顿交响乐团指挥了几十年。
埃多·德·瓦尔特(1977-1985)这位年轻的荷兰指挥家给交响乐带来了冒险精神。与约翰·亚当斯(John Adams)一起，德·瓦尔特开创了一系列影响深远的当代音乐，尽管演奏的技术质量开始下滑。亚当斯被任命为新的音乐顾问，成为全国范围内有作曲家驻场的管弦乐队的典范。
赫伯特·布洛姆施泰特(1985-1995)布洛姆施泰特极大地提高了演奏标准，为乐团接近19世纪和20世纪初的经典作品创造了一个参考点，并通过雄心勃勃的巡演和录音项目提高了交响乐团的国际地位。这些努力的成果至今仍能在乐团的演出中听到。
迈克尔·蒂尔森·托马斯(1995 -)托马斯作为音乐总监的漫长而卓有成效的时期几乎肯定会成为交响乐团历史上最重要的一章。通过他的招聘和领导，他将乐团重塑为一个流动、机智和专业的演奏团体。他引入了丰富的节目计划，极大地扩展了曲目，并留下了将持续几代人的音乐遗产。